Como una importante iniciativa, los investigadores y miembros del Instituto mantienen al Museo de Historia Natural, el cual contiene representaciones y piezas paleontológicas de importancia.
A través de dichas representaciones, se promueve el interés y preocupación por el cuidado del ambiente y de los ecosistemas.
La Escuela Politécnica Nacional (EPN), a través del Museo se encuentra empeñada en contribuir con la educación ambiental, sensibilización y concientización de los estudiantes y público en general. En pocas horas de visita al Museo podrán tener una visión más exacta de la naturaleza ecuatoriana, la biodiversidad, los ecosistemas, la problemática ambiental, como base para la conservación y uso sustentable de los recursos naturales.
Los distintos niveles de los planteles educativos de la provincia de Pichincha y del país, pueden complementar y reforzar los contenidos de sus clases de Ciencias Naturales, Biología, Ecología, Geología, Sistemática, Historia Natural, asistiendo a las charlas que brindan los guías basándose en las representaciones museológicas de las salas del Museo de Historia Natural y del grupo de especialistas del Instituto de Ciencias Biológicas.
Murales de historia natural
Muestran los organismos de cada era o periodo y sus cambios y adaptaciones a través del tiempo
Sala de paleontología
Se exhibe la osamenta de un mastodonte, la maqueta de un dinosaurio, tigre dientes de sable restos óseos de perezoso gigante caballos, y dos dioramas: uno del Bosque Petrificado de Puyango y el del Pleistoceno.
Dioramas
Son representaciones de un hábitat de los diferentes ecosistemas de las cuatro regiones ecuatorianas. Tienen elementos del ambiente, vegetación característica y de su fauna. Los ecosistemas mencionados son:
Diorama de Mataje
Diorama de la Costa
Diorama de manglar
Diorama de las estribaciones orientales
Diorama Páramo del Chimborazo
Diorama Páramo de Frailejones.
Diorama inundado y bosque de tierra firme del Cuyabeno
Diorama marino y terrestre de Galápagos
En los dioramas de exhibición existen varios ejemplares de la fauna ecuatoriana que han sido naturalizados para la exhibición. Estos animales figuran en los respectivos catálogos de los distintos grupos de vertebrados.
Se ha instalado una serie de juegos interactivos en los dioramas con sensores que permitan el autoaprendizaje de los visitantes.
Vitrinas didácticas
Para la exhibición de ejemplares de la fauna de los principales grupos de vertebrados e invertebrados representativos de la fauna del Ecuador.
Elementos que se exhiben en vitrinas y modelos.
Terrarios
Existen cuatro terrarios y trece acuarios con anfibios, reptiles y peces vivos.
Visitantes
El Museo recibe la visita de unas 1000 personas al año. Sin embargo, se espera que a partir del 2008 y una vez que se hayan finalizado los trabajos del Museo, el número de visitantes se incremente notablemente.
Ubicación
Instituto de Ciencias Biológicas, subsuelo del Teatro Politécnico.