Cabe destacar, que la EPN, según el Ranking Nature Index ocupa el puesto 61 a nivel general de Sudamérica, y obtuvo el puesto número 6 a nivel de Sudamérica en investigación de Ciencias de la Tierra y Ambiente, gracias al grado superior de participación en artículos de alto impacto.
El índice Nature Index proporciona una clasificación de instituciones basándose en su participación e impacto en diferentes ramas de la ciencia. Para hacerlo, reúne 68 revistas de impacto, estas publicaciones representan menos del 1% de las revistas que cubren las ciencias naturales en la Web of Science, mientras que son fuente de cerca del 30% del total de las citas usadas en estos campos.